赤塚植物園は本園、万葉・薬用園及び農業園の3つのエリアで構成されています。本園エリアは、樹木見本園として多くの種類の樹木が植えられ、林床には区の花ニリンソウなどの野草が可憐な花を咲かせます。

万葉・薬用園エリアは、万葉集に詠まれた植物や薬用植物が植えられています。案内板に万葉集の歌が書かれており、楽しく学べるようになっています。農業園エリアは、農作物の花や果実が実っている様子を観ることができます。近くには、美術館・郷土資料館・都立赤塚公園があり、自然に恵まれた散策コースになっています。